MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Methylobacterium radiotolerans JCM 2831 plasmid pMRAD08

Total Repeats: 367

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010507	GCC	2	6	554	559	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170744978
2	NC_010507	GCC	2	6	678	683	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170744978
3	NC_010507	GCC	2	6	723	728	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170744978
4	NC_010507	GC	3	6	749	754	0 %	0 %	50 %	50 %	170744978
5	NC_010507	GCC	2	6	782	787	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170744979
6	NC_010507	CGG	2	6	824	829	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170744979
7	NC_010507	CGG	2	6	850	855	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170744979
8	NC_010507	TTG	2	6	874	879	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170744979
9	NC_010507	GCC	2	6	896	901	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170744979
10	NC_010507	TCGTGC	2	12	918	929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170744979
11	NC_010507	GCT	2	6	940	945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170744979
12	NC_010507	CGA	2	6	1011	1016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170744979
13	NC_010507	GGC	2	6	1021	1026	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170744979
14	NC_010507	GGC	2	6	1066	1071	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170744979
15	NC_010507	CGCCC	2	10	1078	1087	0 %	0 %	20 %	80 %	170744979
16	NC_010507	CTCGG	2	10	1214	1223	0 %	20 %	40 %	40 %	170744979
17	NC_010507	GCC	2	6	1268	1273	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170744979
18	NC_010507	GT	3	6	1293	1298	0 %	50 %	50 %	0 %	170744979
19	NC_010507	CGCCC	2	10	1300	1309	0 %	0 %	20 %	80 %	170744979
20	NC_010507	CGC	2	6	1429	1434	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170744979
21	NC_010507	GGC	2	6	1437	1442	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170744979
22	NC_010507	GCC	2	6	1487	1492	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170744979
23	NC_010507	GCG	3	9	1552	1560	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170744979
24	NC_010507	CTG	2	6	1658	1663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170744979
25	NC_010507	GC	3	6	1682	1687	0 %	0 %	50 %	50 %	170744979
26	NC_010507	GGGCC	2	10	1702	1711	0 %	0 %	60 %	40 %	170744979
27	NC_010507	CGGC	2	8	1722	1729	0 %	0 %	50 %	50 %	170744979
28	NC_010507	CCGGC	2	10	1820	1829	0 %	0 %	40 %	60 %	170744979
29	NC_010507	GCC	2	6	1897	1902	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170744979
30	NC_010507	GCG	2	6	1926	1931	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170744979
31	NC_010507	GGAAGC	2	12	1963	1974	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	170744979
32	NC_010507	CAG	2	6	1997	2002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170744979
33	NC_010507	GCG	2	6	2014	2019	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170744979
34	NC_010507	AG	3	6	2038	2043	50 %	0 %	50 %	0 %	170744979
35	NC_010507	TGC	2	6	2074	2079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170744979
36	NC_010507	CTTTT	2	10	2155	2164	0 %	80 %	0 %	20 %	170744980
37	NC_010507	CG	4	8	2193	2200	0 %	0 %	50 %	50 %	170744980
38	NC_010507	AC	3	6	2236	2241	50 %	0 %	0 %	50 %	170744980
39	NC_010507	GC	3	6	2244	2249	0 %	0 %	50 %	50 %	170744980
40	NC_010507	GCC	2	6	2308	2313	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170744980
41	NC_010507	GGC	2	6	2420	2425	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170744980
42	NC_010507	GGC	2	6	2489	2494	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170744980
43	NC_010507	CTCG	2	8	2507	2514	0 %	25 %	25 %	50 %	170744980
44	NC_010507	CCG	2	6	2539	2544	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170744980
45	NC_010507	CGC	2	6	2567	2572	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170744980
46	NC_010507	CGC	2	6	2584	2589	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170744980
47	NC_010507	GCCG	2	8	2604	2611	0 %	0 %	50 %	50 %	170744980
48	NC_010507	GCC	2	6	2633	2638	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170744980
49	NC_010507	GC	4	8	2753	2760	0 %	0 %	50 %	50 %	170744980
50	NC_010507	CGC	2	6	2800	2805	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170744980
51	NC_010507	GCCG	2	8	2812	2819	0 %	0 %	50 %	50 %	170744980
52	NC_010507	GCT	2	6	2855	2860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170744980
53	NC_010507	TCG	2	6	2904	2909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170744981
54	NC_010507	CTGCC	2	10	2975	2984	0 %	20 %	20 %	60 %	170744981
55	NC_010507	CGG	2	6	2992	2997	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170744981
56	NC_010507	CGG	2	6	3048	3053	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170744981
57	NC_010507	GGC	2	6	3073	3078	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170744981
58	NC_010507	ATG	2	6	3082	3087	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170744981
59	NC_010507	AGA	3	9	3096	3104	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170744982
60	NC_010507	CAT	2	6	3366	3371	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170744982
61	NC_010507	AAGGGC	2	12	3379	3390	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	170744982
62	NC_010507	GC	3	6	3428	3433	0 %	0 %	50 %	50 %	170744982
63	NC_010507	GCG	2	6	3443	3448	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170744982
64	NC_010507	TGA	2	6	3452	3457	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170744982
65	NC_010507	CCG	2	6	3489	3494	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170744982
66	NC_010507	CGG	2	6	3495	3500	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170744982
67	NC_010507	CCGG	2	8	3573	3580	0 %	0 %	50 %	50 %	170744982
68	NC_010507	CGC	2	6	3585	3590	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170744982
69	NC_010507	CCTCGA	2	12	3597	3608	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	170744982
70	NC_010507	CGAGGC	2	12	3651	3662	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	170744982
71	NC_010507	GGCCGC	2	12	3690	3701	0 %	0 %	50 %	50 %	170744982
72	NC_010507	TCATCG	2	12	3737	3748	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	170744982
73	NC_010507	GCC	3	9	3760	3768	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170744982
74	NC_010507	GCC	2	6	3790	3795	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170744982
75	NC_010507	GCTCA	2	10	3828	3837	20 %	20 %	20 %	40 %	170744982
76	NC_010507	CA	3	6	3836	3841	50 %	0 %	0 %	50 %	170744982
77	NC_010507	CG	3	6	3896	3901	0 %	0 %	50 %	50 %	170744982
78	NC_010507	GCC	2	6	3922	3927	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170744982
79	NC_010507	GC	4	8	4010	4017	0 %	0 %	50 %	50 %	170744982
80	NC_010507	CTCG	2	8	4038	4045	0 %	25 %	25 %	50 %	170744982
81	NC_010507	CGA	2	6	4068	4073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170744982
82	NC_010507	CGT	2	6	4088	4093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170744982
83	NC_010507	GCC	2	6	4123	4128	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170744982
84	NC_010507	GGC	2	6	4134	4139	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170744982
85	NC_010507	GGCC	2	8	4154	4161	0 %	0 %	50 %	50 %	170744982
86	NC_010507	CCT	2	6	4292	4297	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170744982
87	NC_010507	GCC	2	6	4435	4440	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170744982
88	NC_010507	TGTCC	2	10	4493	4502	0 %	40 %	20 %	40 %	170744983
89	NC_010507	GC	3	6	4524	4529	0 %	0 %	50 %	50 %	170744983
90	NC_010507	TCG	2	6	4613	4618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170744983
91	NC_010507	GTG	2	6	4703	4708	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170744983
92	NC_010507	CGC	2	6	4782	4787	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170744983
93	NC_010507	G	6	6	4826	4831	0 %	0 %	100 %	0 %	170744983
94	NC_010507	GCCC	2	8	4872	4879	0 %	0 %	25 %	75 %	170744983
95	NC_010507	CGC	2	6	4882	4887	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170744983
96	NC_010507	T	6	6	4938	4943	0 %	100 %	0 %	0 %	170744983
97	NC_010507	CGC	2	6	5024	5029	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170744984
98	NC_010507	GCA	2	6	5037	5042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170744984
99	NC_010507	CGC	2	6	5046	5051	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170744984
100	NC_010507	CCA	2	6	5093	5098	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170744984
101	NC_010507	ACAGC	2	10	5149	5158	40 %	0 %	20 %	40 %	170744984
102	NC_010507	CGG	2	6	5163	5168	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170744984
103	NC_010507	CG	3	6	5200	5205	0 %	0 %	50 %	50 %	170744984
104	NC_010507	CGT	2	6	5265	5270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170744984
105	NC_010507	GAG	2	6	5272	5277	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170744984
106	NC_010507	CGG	2	6	5304	5309	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170744984
107	NC_010507	GAC	2	6	5368	5373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170744984
108	NC_010507	GC	3	6	5382	5387	0 %	0 %	50 %	50 %	170744984
109	NC_010507	GC	3	6	5401	5406	0 %	0 %	50 %	50 %	170744984
110	NC_010507	GCG	2	6	5429	5434	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170744984
111	NC_010507	GCC	2	6	5452	5457	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170744984
112	NC_010507	TGA	2	6	5463	5468	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170744984
113	NC_010507	GCC	2	6	5470	5475	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170744984
114	NC_010507	CGCC	2	8	5480	5487	0 %	0 %	25 %	75 %	170744984
115	NC_010507	CGCGC	2	10	5550	5559	0 %	0 %	40 %	60 %	170744985
116	NC_010507	GCG	3	9	5574	5582	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170744985
117	NC_010507	CCG	2	6	5589	5594	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170744985
118	NC_010507	CGC	2	6	5598	5603	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170744985
119	NC_010507	ACG	2	6	5604	5609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170744985
120	NC_010507	CCG	2	6	5643	5648	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170744985
121	NC_010507	GCCG	2	8	5656	5663	0 %	0 %	50 %	50 %	170744985
122	NC_010507	GGCGCC	2	12	5813	5824	0 %	0 %	50 %	50 %	170744985
123	NC_010507	AGCA	2	8	5844	5851	50 %	0 %	25 %	25 %	170744985
124	NC_010507	TGA	2	6	6050	6055	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170744985
125	NC_010507	CCG	2	6	6104	6109	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170744985
126	NC_010507	AGGC	2	8	6161	6168	25 %	0 %	50 %	25 %	170744985
127	NC_010507	CG	3	6	6214	6219	0 %	0 %	50 %	50 %	170744985
128	NC_010507	CAC	2	6	6273	6278	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170744985
129	NC_010507	CCTG	2	8	6328	6335	0 %	25 %	25 %	50 %	170744985
130	NC_010507	GGC	2	6	6366	6371	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170744985
131	NC_010507	GCCG	2	8	6395	6402	0 %	0 %	50 %	50 %	170744985
132	NC_010507	CGC	2	6	6614	6619	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170744985
133	NC_010507	CGG	2	6	6628	6633	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170744985
134	NC_010507	GGC	2	6	6646	6651	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170744985
135	NC_010507	CGT	2	6	6668	6673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170744985
136	NC_010507	CGG	2	6	6701	6706	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170744985
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261	NC_010507	GCCG	2	8	13545	13552	0 %	0 %	50 %	50 %	170744991
262	NC_010507	C	6	6	13584	13589	0 %	0 %	0 %	100 %	170744991
263	NC_010507	CGGT	2	8	13656	13663	0 %	25 %	50 %	25 %	170744991
264	NC_010507	GTTAT	2	10	13702	13711	20 %	60 %	20 %	0 %	170744992
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.